Según varios historiadores, los territorios del municipio de Villamaria pertenecieron en la época precolombina a la nación Quimbaya.

Esta civilización estaba sectorizada a su vez en las tribus de Pormasa, Oruma, Sazapa, Pindaná, Sazagua, Sazaguabi, Rimbozo, Yago- Yago, Soytama, Orobi, Tataquí, Quindio, Chinchiná, Tanambi, Perombozo, Pampana, Pagua, Co y Cagamo, y tradicionalmente se le ha matriculado como descendiente de los caribes, versión  muy cuestionada en la actualidad por respetados historiadores que la sitúan como pertenecientes a los Sinues.

La tribu Quimbaya habitaba las vertientes occidentales de la cordillera Central que descienden al río Cauca, en el sector encerrado al sur por la quebrada de Los Micos y el río Guacaica al norte. El río Cauca servia de límite natural por el occidente, mientras que la alta cordillera Central formaba el límite oriental.

Con mucho fundamento se puede asegurar que las primeras pisadas realizadas por una persona civilizada en los predios de Villamaria correspondieron a las efectuadas por el señor Fermín López. Tan tajante afirmación se hace después de haber consultado la obra de don Luis Londoño O., “Historia de Manizales”, y  al Presbítero José Fernando López Montes en su “Historia de Aranzazu”. De ambos libros se colige que don Fermín López y su familia se dirigieron hacia estos lares en busca de sustento y de maderas para levantar algunas construcciones en el paraje denominado “Morro de San Cancio”, centro de operaciones del aguerrido colonizador.

A los pocos meses de estancia en el mencionado lugar, el señor López se vio obligado a emigrar a otras tierras pasando por Villamaria rumbo hacia el sur, para evadir eventuales problemas con la compañía González y Salazar virtual dominadora de gran parte del territorio de la provincia antioqueña cuyo límite se presumía estaba en el río Chinchiná. El destino del osado colonizador lo constituyó el territorio del hoy municipio de Santa Rosa de Cabal, de cuya fundación se ocupó a los pocos días de su llegada.

A mediados de 1.848 legendarios colonizadores ávidos de aventuras y en busca de mejores perspectivas, se dirigieron desde Neira hacia el sur, en la famosa Expedición de los Veinte con el exclusivo fin de fundar una población. Esta empresa se llevó a cabo con la fundación de un caserío al que más tarde se le dio el nombre de Manizales y que a medida que fué pasando el tiempo se fué consolidando con la llegada de gran cantidad de vecinos procedentes de Neira, Salamina, Pácora, Aguadas, Sonsón, Abejorral y Rionegro.  Desafortunadamente para estos inmigrantes sus anhelos de superación y de progreso se vieron frustrados por la intransigencia de la compañía de González y Salazar que se negaba a  otorgarles parcelas de labranzas. En vista de las diversas circunstancias, algunos de los primeros pobladores fijaron sus miradas en un paraje cercano a la población recién fundada y que según sus conocimientos pertenecía al Estado Soberano del Cauca, motivo por el cual la Compañía González y Salazar no podía reclamar por que estaba al margen de sus dominios.. En estas condiciones un grupo de colonizadores se encaminó hacia el sur, atravesaron el río Chinchiná y en la margen izquierda de la mencionada corriente empezaron a levantar algunas chozas de paja, exactamente en el sitio que hoy se conoce como barrio La Capilla.

El naciente caserío  (en el paraje La Capilla) en sus primeros años de fundación entró a formar parte administrativamente de la jurisdicción de Manizales con el nombre de Partido de Chinchiná hasta mediados de 1.851, año en el cual los vecinos de la fundación decidieron por unanimidad llamarla ALDEA DE MANA, nombre que se origina en las características especiales de estas tierras tocadas por la fertilidad y la generosidad para producir óptimos frutos.

A finales de 1,851 y por motivo de las constantes incursiones de la compañía González y Salazar a estos predios, los habitantes de la Aldea de Maná, se constituyeron en juntas y de inmediato solicitaron al gobierno del Estado Soberano de Cauca erigiera oficialmente el nuevo caserío... El memorial de solicitud iba firmado por la mayoría de los fundadores y había sido redactado por don Ezequiel Arango, el más versado y culto de los colonizadores. El nombre solicitado en el documento petitorio era el de Aldea de Maná. El ejecutivo de inmediato atendió el memorial, procedente del naciente caserío, pero debido a la ilegibilidad de la palabra Maná, gestionó la solicitud a través de una providencia en la que daba vida a la ALDEA DE MARIA. Esta providencia fué expedida en Buga el 19 de octubre de 1.852.

Marco Naranjo Lopez, Enrique Naranjo Marin, Hernando Naranjo Marin, Gerardo Arias Mejia, Manuel Orozco Patiño, Jose Jesus Gonzales Usma, Capitan Jaime Duque Grisales,  Daniel Gallego Echeverri, Fabio Gallego Echeverri,  Hernando Henao Correa, Ramon Cardona Osorio, Jaime Arturo Aristizabal, Guido Echeverri Piedrahita, Alonso Medina Cardona, Emilio A. Giraldo Lopez, Gerardo Garcia Arcila, Uriel Narvaez Alzate, Alonso Rios Valencia, Eli Ramirez Aristizabal, Ramon Elias Posada Jimenez, Misia Rosa Ramirez.

Pintores:  John D’ Greck, Vicente Matijasevic, Luz Marina Jimenez, Martín Ernesto Cardona,  Javier Cardona, Luis Carlos Buitrago y  Francisco González.

Escritores:  Abel Marín, poeta; Emilio Arias Mejía, poeta, obra: El Verbo Amar; Rogelio Escobar, obra: Colombia en la Prehistoria Americana; Alfonso Mejía Robledo, novelista, obra Un Colombiano en Apuros y Un Héroe Sin Aventura; Gerardo Arias Ramírez, educador, insigne;  Héctor Fabio Pineda Cardona, ensayista, autor del libro Villamaría y su Historia. Hernando Henao Correa, autor de  una historia de Villamaria y de la letra del himno.

Sacerdotes: Jose Antonio Marin Lopez, Manuel Victor Restrepo Baron, Luis Gonzaga Ortiz Alzate, Bernardo Naranjo Giraldo y Luciano Arias Cruz.

HIMNO DE VILLAMARIA

Obra del ciudadano Hernando Henao Correa, aprobado por acuerdo 018 de 1.977.

I

Hermosa Villa, Andina y altanera,

caudal inmenso, puerto celestial,

fereces campos y bondad cimera,

aureolada con nombre virginal,

II

De Colombia Villa de las flores

y de Caldas bella rosa en botón

majestuosa heredad de mis mayores

el Hacedor guió tu fundación.

III

De las Nereidas yergues el paisaje

de tu raza eres hogar feliz,

de tiples y guitarras su cordaje,

candorosa beldad, orto del Ruiz.

IV

Paraíso de amor resplandeciente

de grata espera frondaje proverbial,

ubérrimo jardín magnificante,

perfumado vergel primaveral.

V

Base agraria pluricultivista

suelo rico de aurífero filón

y tu gente al progreso siempre lista;

del trabajo eres un bastión

VI

Eres  emporio de industria y de riqueza,

eres sede de paz, bien cultural,

tus hijos proclamamos tu grandeza,

en oración a Dios, luz celestial